台北醫學大學有關生藥之研究，起始於民國五十二年（一九六三年），台北醫學院首任院長故徐千田博士遠赴日本國立京都大學禮聘顏焜熒教授返國，建立首座植物化學研究室，除負責本學院生藥學及中藥相關化學課程之教學外，亦是本學校研究生藥之骨幹。於民國七十二年，本校第一所研究所－藥學研究所成立時，招收首屆生藥組碩士班學生，並於民國七十五年成立博士班。七十九年十二月胡俊弘院長為配合健康科學大學之設立，擴大藥學院之架構，向教育部提出「生藥學研究所」之申請，隔年十一月十八日奉教育部台 (80) 高 61500字號函核准，並經院務會議通過，成立台灣第一所「生藥學研究所」，由顏焜熒教授擔任首任所長。第一屆碩士班研究生於八十一年六月正式招生，而於八十三年六月有第一屆畢業生，同年八月由楊玲玲教授接任第二任所長，直至八十九年七月屆滿。其後行政業務由李美賢副教授及徐鳯麟教授暫代，九十年八月續由徐鳯麟教授正式接掌本所，積極新聘兼任教師，規劃教學、研究及課程之整合。並於李美賢副教授、王靜瓊副教授、侯文琪副教授、陳彥州副教授、梁文俐助理教授之外，陸續增聘李慶國教授、李宗徽助理教授、盧重光助理教授、楊文彬助理教授、蔡祐輔助理教授等，增加教學陣容。自成立至九十五學年度為止，已孕育了十 四屆畢業生。